代理記賬機構有3名以上持有會計從業(yè)資格證書的專職從業(yè)人員，且主管該業(yè)務的負責人具有會計師以上技術職稱資格。但實際執(zhí)行中，相當部分的機構不符合此規(guī)定。
實際執(zhí)行中很多操作不規(guī)范、內部管理制度不健全現(xiàn)象十分普遍，部分機構的內部管理制度即使制定也是形同虛設。
業(yè)務收費標準混亂。在收費標準上，各家機構懸殊較大，有些代理記賬機構甚至通過進行惡意競爭，還有部分自身的經營收入核算不規(guī)范，隱匿收入現(xiàn)象也較普遍。

代理記賬機構執(zhí)業(yè)質量不樂觀。會計核算方面尚存在許多不規(guī)范之處，一些會計核算未能以權責發(fā)生制為基礎，對所代理公司未按《公司法》計提法定公積金、法定公益金的現(xiàn)象也較普遍，代理編制的年度財務會計報告都只有基本會計報表，均未按制度規(guī)定的要求提供會計報表附注的內容等。
對于代理記賬還需要繼續(xù)宣傳其重要意義和作用。2000年7月1日《中華人民共和國會計法》已經開始實施，我們可以借助法律的性，進行宣傳，進一步其法律地位，增強人們，特別是一些規(guī)模較小的經濟組織及個體工商戶對代理記賬的認識。

對于代理記賬可以采取針對性措施，積極推動其的實施。除了有關部門單位大力宣傳以外，應當由稅務部門牽頭推動其實施。一是稅務部門同規(guī)模較小的單位組織，特別是一些規(guī)模較小的經營組織和個體工商戶聯(lián)系緊密，推廣工作力度大；
二是稅務部門本身有這方面的經驗，一方面，稅務部門在建制建賬上有著豐富的經驗，另一方面，前幾年稅務部門曾進行過組織、督促小型經濟組織及個體工商戶建制建賬工作，只是由于種種原因沒有堅持下來；再有就是現(xiàn)有的稅務師事務所可以馬上開展這項業(yè)務。

審核會計對記賬會計做賬結果進行審核，包括票據(jù)完整性、合法性的審核、賬務處理正確性的審核、稅款計算合法性的審核、往來賬的核對、并對客戶賬務問題的隱患給予準確評估。在所有賬務審核無誤后填制稅務納稅申報表，稅收繳款書，并對納稅情況與客戶溝通。為客戶代理記賬,并辦理稅務登記，減免稅手續(xù)，一般稅人申請手續(xù)、發(fā)票審批手續(xù)等。
根據(jù)新的《注冊會計師法》規(guī)定：第十五條：“注冊會計師可以承辦會計咨詢、會計服務業(yè)務?！睆亩鵀榇碛涃~業(yè)務的開展提供了合法的中介機構。
一個單位是否選擇“代理記賬”取決于該單位是否具備配備專職會計人員的條件，這應該由各單位根據(jù)自身會計業(yè)務的需要自主決定。一般而言，單位規(guī)模的大小、經濟業(yè)務和財務收支的繁簡程度、經營管理的要求等，是決定單位是否配備專職會計人員的主要因素。單位規(guī)模大、經濟業(yè)務多、財務收支量大、在經營管理上要求高的單位，一般應該單設置會計機構并配備專職的會計人員，以便及時組織本單位各項經濟活動和財務收支的核算，實行有效的會計監(jiān)督，以會計工作的效率和會計信息的質量。